成立于1977年的欧洲专利局（European Patent Office，简称EPO）是欧洲专利申请与授权环节中最重要的执行机构，与美国专利商标局（United States Patent and Trademark Office，简称USPTO）和日本专利局（Japan Patent Office，简称JPO）并称世界三大专利局，并且也是世界上最大的区域性专利局。自1977年成立时的8个成员国到如今的38个成员国和2个延伸国，欧洲专利局一直致力于开拓成员伙伴。值得敬佩的是，作为具有一定行政属性的部门，欧洲专利局在财务上实行自治，其运营支出来源于专利申请人和专利权人缴纳的费用，高质量的专利服务水平无疑是欧洲专利局长期坚持的原则。
欧洲专利局的主要职能是负责各成员国申请人提交的欧洲专利申请、审批、异议、上诉等工作，其建立以《欧洲专利公约》为法律基础，根据《公约》第15条的规定，欧洲专利局设置的主要部门及其工作职能为：
| 主要部门 | 工作职能 |
| 受理处（Receiving Section） | 对欧洲专利申请进行形式审查 |
| 检索部（Search Sections） | 作出欧洲专利检索报告 |
| 审查部（Examining Divisions） | 对欧洲专利申请进行实质审查 |
| 异议部（Examining Divisions） | 审查公众对欧洲专利提出的异议 |
| 法律部（Legal Division） | 管理专利登记簿及专利代理人 |
| 上诉委员会（Boards of Appeal） | 处理对以上部门决定不服的上诉 |
| 扩大上诉委员会（Enlarged Board of Appeal） | 统一法律适用，解决重大法律争议 |
在部门数量上，欧洲专利局设置一个受理处、多个检索部、多个审查部、多个异议部、一个法律部、多个上诉委员会、一个扩大上诉委员会。
欧洲专利局位于德国慕尼黑，下属设立五个业务总部，除第一总部位于荷兰海牙之外，其余四个总部也都位于德国慕尼黑。五个业务总部各有分工为：
| 总部 | 业务分工 |
| 第一业务总部 | 专利申请的形式审查，专利检索 |
| 第二业务总部 | 专利申请的实质审查，专利异议 |
| 第三业务总部 | 上诉委员会，扩大上诉委员会 |
| 第四业务总部 | 一般性的专利行政服务 |
| 第五业务总部 | 处理法律事务和国际事务 |
上述五个业务总部分别由欧洲专利局的副局长担任负责人，该副局长由行政理事会任命。欧洲专利局的工作人员、总部的负责人及其他工作人员需要尽到非常严格的保密义务，即使从工作岗位上离职，也不得向第三方披露任何在其工作期间具有保密要求的信息。
为了加强沟通联络，经成员国或工业产权方面的政府间组织同意，欧洲专利局可以根据需要在成员国或上述组织设立分局。目前，欧洲专利局在布鲁塞尔设立了分局，但该分局的作用仅限于联络，并不具有受理欧洲专利申请的职能。
